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做一、二代试管是不会影响试管生男生女的比例的，因为无法确定胚胎是男是女，自然也无法针对地选择移植。所以也无法说做试管婴儿生男孩还是生女孩的几率更大。但三代试管即胚胎植入前遗传筛查是能够明确胚胎染色体是否有问题，是男是女，所以就会有人有选择地移植，从而影响试管生男生女的比例。目前国内是禁止非医学原因进行性别选择的，所以有这方面需求的夫妇会到国外做三代试管，比如泰国、美国、马来西亚。
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